腰背痛是强直性脊柱炎最常见的症状，是病情活动的指标之一。疼痛的位置包括腰部、下背部及腰骶部。因为强直性脊柱炎主要侵犯中轴关节且病变发展趋势大部分是由下而上，所以骶髂关节和腰椎受累几乎见于所有该病患者，其发生率在90％以上。骶髂关节炎症早期一般比较隐匿，所以早期腰痛只表现为腰骶部不适或隐痛，有些患者只在劳累后发作，呈间歇性或两侧交替性酸痛，或表现为臀深部不适感。

　　另有一些患者，可能有外伤或其他诱因，表现腰骶部疼痛突然发作，疼痛剧烈不能活动，或伴发热，似机械性腰痛或急性炎症改变，卧床休息数日后，疼痛可缓解或消失。这种情况可反复出现，有逐渐加重的趋势。初期疼痛的部位常位于腰骶部，可为单侧，以后逐渐进展为双侧，疼痛严重时可放射至髂嵴、耻骨联合、双鼠溪部、坐骨结节和大腿后方，咳嗽、喷嚏、弯腰等动作的牵拉可使疼痛突然加重。

　　随着病情进一步发展，隐痛或间歇痛会变成持续性腰骶部酸痛、刺痛和臀深部钝痛或腰、骶、臀等部位难以言状的酸胀不适感，夜间较重，影响睡眠，甚至在睡眠中痛醒，常常不得已下床活动以减轻疼痛。晨起或长时间保持一个姿势，会出现腰部僵硬感，疼痛也会加重，稍事活动后又会减轻。有些患者腰部怕风怕凉，常喜多加衣被，遇风寒潮湿疼痛加重，遇温遇热则疼痛减轻。疼痛严重时病人不能下床活动，翻身困难。夜间休息痛是病情活动的指征之一。

　　一般而言，腰痛或僵硬休息不能缓解，适当的活动反而能够减轻症状，这是炎症性腰痛的特点，可依此与机械性腰痛进行鉴别。后者活动或劳累后加重而休息能使症状缓解。但当疼痛严重以致不能活动时，这个特点常常被掩盖，临床上需仔细鉴别。

　　有些患者腰痛或不适症状较轻未引起重视。病人仅表现腰部僵痛或腰肌酸痛，或有椎旁压痛时很容易与风湿性多肌痛、肌筋膜炎、纤维织炎神经痛或精神性疼痛相混淆；当出现单侧臀部或大腿后侧疼痛时，又容易被误诊为坐骨神经痛或腰肌劳损。强直性脊柱炎臀腿疼痛一般很少放射至膝关节以下。