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HLAB27检查，对早期幼年强直性脊柱炎患者及对临床表现不典型者的诊断意义较大。因为约82～95％的幼年强直性脊柱炎患者为HLAB27阳性。HLAB27阳性者患幼年强直性脊柱炎的相对危险度，是HLAB27阴性者的100倍以上。因此检查HLAB27对本病的诊断与鉴别诊断很有帮助。

对已确诊的幼年强直性脊柱炎患者，检查HLAB27有助于判定病情严重性及预后。因为HLAB27阳性者病情往往较重，出现慢性背痛、骶髂关节炎、皮肤粘膜病变以及发热，体重下降与多汗等全身症状较多见，而HLAB27阴性者发病年龄一般较晚，较少发生前面提到的关节外表现等。

因此有人把幼年强直性脊柱炎的心脏与眼病变(主要指主动脉 瓣关闭不全、严重的心脏房室传导阻滞以及眼虹膜睫状体炎等)称为HLAB27相关性疾病。