1、遗传因素是重要的强直性脊柱炎的病因之一。据流行病学调查，AS病人HLA-B27阳性率高达90%～96%，而普通人群HLA-B27阳性率仅4%～9%;HLA-B27阳性者强直性脊柱炎的发病率约为10%～20%，而普通人群发病为1‰～2‰，相差约100倍。

　　2、常见的强直性脊柱炎的病因有感染。Ebrimger等发现强直性脊柱炎患者的大便中肺炎克雷白菌检出率为79%，而对照组<30%;在AS活动期中肠道肺炎克雷白菌的携带率及血清中针对该菌的IgA型抗体滴度均较对照组高，且与强直性脊柱炎的病情活动呈正相关。

　　3、　经专家研究，自身免疫也可能是强直性脊柱炎的病因之一。有人发现60%强直性脊柱炎患者血清补体增高，大部分病例有IgA型类湿因子，血清C4和IgA水平显著增高，血清中有循环免疫复合物(CIC)，但抗原性质未确定。以上现象提示免疫机制参与强直性脊柱炎的发病。